CH STS udøver taktisk kommando over tildelte enheder i fm. styrkeindsættelse i operationer eller som styrkeproducent i samvirkerelateret øvelsesøjemed på Commander Task Group (CTG) niveau i eget kommandoskib (Absalon-klassen).

STS bidrager derudover med stabselementer (officerer og sergenter) til Commander Combined Joint Task Force (COMCJTF) hovedkvarterer og Maritime Component Commander (MCC) og Commander Task Force (CTF) hovedkvarterer.

STS udfører således maritim operativ planlægning samt udfører ledelse af maritime operationer i såvel national såvel som i multinational sammenhæng.

Derudover forestår STS national samvirke-øvelsesplanlægning og gennemførelse. De nationale øvelser, som STS er ansvarlige for er PLAYEX-serien (PLAYEX I, PLAYEX II/ BALTIC BRIDGE II) og DANEX-serien.

Yderligere deltager STS i NATO øvelser og i udenlandske nationale maritime øvelser, typisk hhv. MARINER-serien i NATO regi (LOYAL MARINER, BRILLIANT MARINER, NOBLE MARINER), NEPTUN WARRIOR i UK regi samt af og til i MULTINATIONAL MARITIME EXERCISE i US regi.

STS er ansvarlig for planlægning og gennemførelsen af søværnets Operational Rediness Evaluation (OPREDEVAL) af 2. Eskadres enheder, før disse indgår som elementer i NATO Response Force eller som styrkebidrag til en Coalition of the Willing and capable Operation.

STS nærmeste samarbejdspartnere i søværnet er Søværnets Operative Kommando, Søværnets Skolestruktur, Søværnets Operative Logistiske støttecentre, 2. Eskadre, der er styrkeproducent af enheder til internationale operationer samt de sejlende enheder i 2. Eskadre.

STS har derudover et tæt samarbejde med øvrige myndigheder i hele søværnet samt med Hæren, Flyvevåbnet og Beredskabsstyrelsen.

Historisk har STS bidraget til US COM 2 FLEET, UK MARFOR og SP MARFOR i øvelsesøjemed.