Søværnet har fem miljøskibe. To store skibe - Gunnar Thorson og Gunnar Seidenfaden - af Supply-klassen, to mindre fartøjer - Mette Miljø og Marie Miljø - af Seatruck-klassen, samt et lægtvandsfartøj (M103) og et antal pramme.

Miljøskibene indsættes i tilfælde af olieforurening i de danske farvande. Skibene kan udlægge flydespærringer for at inddæmme olie, så den ikke spreder sig eller når ind til kysten, og de kan samle olie op med såkaldte skimmere. Prammene anvendes, hvis skibene samler mere olie op, end de selv kan have om bord.

Lægtvandsfartøjet M103 kan med sin dybgang på kun 60 cm komme meget tæt ind på kysten. Også Beredskabsstyrelsen har lægtvandsfartøjer.

Gunnar Seidenfaden deltog i 2002 i oprydningen efter tankskibet Prestiges forlis ved den spanske nordvestkyst.