Eskadrens fire inspektionsskibe THETIS, TRITON, VÆDDEREN og HVIDBJØRNEN, samt inspektionskutteren TULUGAQ og inspektionsfartøjerne af KNUD-klassen (2 stk) er alle bygget med særlig henblik på sejlads i det nordatlantiske område ved Færøerne og Grønland. De er meget sødygtige, kan tåle overisning og de er specielt forstærkede i skroget for sejlads igennem fast havis og i områder med polaris. Inspektionsskibene har basehavn i Frederikshavn.

Skolekutterne ERTHOLM og ALHOLM (HOLM-klassen) og sejlkutterne SVANEN og THYRA bruges til uddannelse af personel herunder kadetter. Skolekutterne har basehavn i Korsør, mens sejlfartøjerne har basehavn i Frederikshavn.

Miljøskibene GUNNAR THORSON, METTE MILJØ, MILJØ 102, GUNNAR SEIDENFADEN, MARIE MILJØ, MILJØ 101 bruges til bekæmpelse af olieforurening i danske og tilstødende farvande. Miljøfartøjerne er placeret i henholdsvis Korsør og Frederikshavn.

Kongeskibet DANNEBROG bruges af kongehuset til besøg i såvel Danmark, Nordatlanten samt andre lande. Kongeskibet har basehavn i Frederikshavn.

Søopmålingsfartøjerne BIRKHOLM og FYRHOLM, SKA 12, SKA 16, O-BÅD 1, O-BÅD 2 bruges til søopmåling i såvel danske som grønlandske farvande. Opmålingsfartøjerne har basehavn i København.

Alle skibene er inddelt i divisioner, der hver ledes af en divisionschef. Divisionschefen udpeges blandt skibscheferne i de skibe, der indgår i divisionen, og han er ansvarlig for samordning af tjenesten om bord og for koordinering af forslag om operative og materiel-mæssige forhold.
 
Division 11: THETIS, TRITON, VÆDDEREN, HVIDBJØRNEN.
Division 14: ERTHOLM, ALHOLM, SVANEN, THYRA
Division 16. GUNNAR THORSON, METTE MILJØ, MILJØ 102
Division 17: GUNNAR SEIDENFADEN, MARIE MILJØ, MILJØ 101, MILJØ 103
Division 19: KNUD RASMUSSEN, EJNAR MIKKELSEN og TULUGAQ.

Udenfor divisionsinddeling:
KYSTREDNINGSTJENESTEN, DANNEBROG, BIRKHOLM, FYRHOLM, SKA 12, SKA 16, O-BÅD 1, O-BÅD 2.

THETIS-klassen (Division 11)
Alle enhederne er bygget på Svendborg Værft i perioden 1988-93. Skibene har moderne beboelse for mandskabet i henholdsvis enkelt og dobbelt lukafer samt meget gode opholdsfaciliteter. Enhederne har tre hovedmotorer, der på fælles gear trækker en fremdrivningspropel. Skibene er forsynet med bovpropel samt med en nedsænkelig hydraulisk drevet propel placeret midt under skibet. Farten er omkring 20 knob, og skibene kan sejle gennem fastis på op til en meters tykkelse. Deres udholdenhed er stor, med mulighed for lange perioder til søs mellem havneanløb og en udsejlet distance på 10.000 sømil med høj fart. Skibene er udstyret med søværnets 76 mm standardkanon og avanceret ildledelsesudstyr. Til opdagelse og bekæmpelse af undervandsbåde er installeret sonar og dybdebomber. Søværnets LYNX helikopter kan underbringes i hangar og andre helikoptere, såsom Grønlandsflys og det færøske luftfartsselskabs mindre helikoptere og den islandske kystvagts redningshelikoptere, kan lande ombord. Skibene er 112 meter lange, 14 meter brede og har en dybgang på 6 meter. Besætningen er på 52 mand. Hertil kommer sejlads med 10-16 værnepligtige, som er ombord i ca. 6 uger i forbindelse med deres uddannelse i søværnet. VÆDDEREN deltog som ekspeditionsskib for GALATHEA ekspeditionen 2006-2007.

Inspektionsskibet VÆDDEREN i isen

Skolefartøjer (Division 14)
Til uddannelsesformål råder eskadren over to skolekuttere ERTHOLM og ALHOLM samt sejlkutterne SVANEN og THYRA. De to førstnævnte er bygget på Danish Yacht i Skagen i 2005 og 2006. Besætningen er på 5 mand. Derudover er der plads til 4 kadetter. Sejlkutterne er bygget på Hundested Bådebyggeri i 1960 – 1961. Fartøjerne er træbyggede af bermudarigget yawl type. De er forsynet med en hjælpemotor men fremdrives normalt for sejl. Den faste besætning er på 4 mand, 1 officer, 1 sergent og 2 konstabler, derudover er der plads til et antal kadetter. Fartøjerne er 18,8 meter lange, 4,80 meter brede og har en dybgang på 2,40 meter.

Sejlkutterne SVANEN og THYRA

Miljøskibe (Division 16 og 17)
GUNNAR THORSON og GUNNAR SEIDENFADEN er bygget ved Ørskov Stålskibsværft i Frederikshavn i 1981. Maskineriet giver en fart på 12 knob. Skibene er 55,60 meter lange, 12,30 meter brede og har en dybgang på 4,60 meter. De har en besætning på 16 mand.

METTE MILJØ og MARIE MILJØ er bygget på Nykøbing Mors Værft i 1979. Far¬ten er 9 knob. Skibene er 29,75 meter lange, 8 meter brede og har en dybgang på 2,40 meter. De har en besætning på 6 mand, heraf 1 officer, 1 sergent og 4 konstabler.

MILJØ 101 og MILJØ 102 er bygget i Svendborg i 1977. De har en fart på 15 knob. Far-tøjerne er 16,40 meter lange, 4,30 meter brede og har en dybgang på 1,90 meter. De har en besætning på 1 officer og 2 konstabler.

Miljøskibet GUNNAR THORSON samler olie

AGDLEK-klassen og KNUD RASMUSSEN-klassen (Division 19)
Division 19 opererer næsten udelukkende ved Grønland og består af tre specialbyggede skibe.

Den ældste enhed i Division 19 er Inspektionskutteret TULUGAQ, der er den sidste operative enhed af AGDLEK-klassen. AGDLEK-klassen bestod oprindeligt af tre enheder, der alle blev bygget på Svendborg Værft i perioden 1974 - 1979. TULUGAQ har en hovedmotor og farten er 12 knob. Kutteren kan bryde fast is på op til en halv meters tykkelse. Den er udstyret med 2 stk. 12,7 mm maskingeværer samt håndvåben til nærforsvar. Kutterne er 31 meter lange, 8 meter brede og har en dybgang på 3 meter. Besætningen er på 14 mand, fordelt på 3 officerer og 11 menige.

De to andre enheder i Division 19 er Inspektionsfartøjerne af KNUD RASMUSSEN-klassen, KNUD RASMUSSEN og EJNAR MIKKELSEN, der blev bygget på Carstensens Skibsværft i Skagen i perioden 2005 - 2008. Inspektionsfartøjerne er forholdsvis store enheder med to hovedmotorer og en fart på op til 17 knob. Inspektionsfartøjerne kan bryde fast is op til næsten en meters tykkelse. Fartøjerne er udstyret med en 76 mm kanon og 2 stk. 12.7 mm maskingeværer samt håndvåben til nærforsvar. Fartøjerne er ca. 72 m lange, 15 m brede og har en dybgang på ca. 5 m. Besætningen er på 19 mand fordelt på 4 officerer, 2 sergenter og 13 menige. Inspektionsfartøjerne har helikopterdæk og kan således operere en helikopter, men har ikke helikopter fast om bord. I agterdelen af skibet er der en hangar til et særligt Search And Rescure (SAR) - fartøj - en hurtigtgående redningsbåd - som kan sejle ud via en rampe agter.      

Kongeskibet
DANNEBROG er bygget på Orlogsværftet i 1932. Skibet er forsynet med 2 hovedmotorer der giver en fart på 14 knob. Skibet er 75,60 meter langt, 10,40 meter bredt og har en dybgang på 3,65 meter. Skibets faste besætning er på 58 mand herunder et antal værnepligtige, derudover kan medføres en kongelig husholdning på 27 samt 14 passagerer.

Kongeskibet DANNEBROG for anker ved Lohals

Søopmålingen
SKA-bådene er bygget i Svendborg i perioden 1981 - 1985. Fartøjerne er bygget af glasfiber og har en fart på 12 knob. De er 19,90 meter lange, har en bredde på 5,20 meter og en dybgang på 2,10 meter. Derudover er der 2 mindre O-både der benyttes ved opmå-ling i lavt vand. I 2007 er to SKA-både udfaset og erstattet af 2 Standardfartøjer MK I, BIRKHOLM og FYRHOLM.